Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HpdP49429 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HpdP49429 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HpdP49429 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HpdP49429 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HpdP49429 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HpdP49429 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HpdP49429 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms