Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cox8bP48772 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms