Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LmnaP48678 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms