Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Epb41P48193 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms