Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rab11bP46638 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms