Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf1P46099 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf1P46099 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms