Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmx2P43687 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmx2P43687 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms