Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fen1P39749 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms