Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Grik2P39087 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Grik2P39087 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms