Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PpargP37238 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PpargP37238 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PpargP37238 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PpargP37238 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms