Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddit3P35639 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms