Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdha1P35486 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms