Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rab20P35295 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rab20P35295 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms