Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab23P35288 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab23P35288 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab23P35288 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab23P35288 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms