Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ptpn11P35235 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms