Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptk2P34152 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms