Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc10P31257 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms