Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa2P31245 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms