Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprmP28828 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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PtprmP28828 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprmP28828 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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