Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxrgP28705 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms