Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gjb3P28231 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms