Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gjb1P28230 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms