Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjc1P28229 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms