Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Xrcc5P27641 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Xrcc5P27641 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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