Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PdgfraP26618 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms