Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZfaP23607 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZfaP23607 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms