Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gja1P23242 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms