Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RarbP22605 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RarbP22605 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RarbP22605 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RarbP22605 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RarbP22605 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RarbP22605 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RarbP22605 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RarbP22605 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RarbP22605 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RarbP22605 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RarbP22605 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RarbP22605 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms