Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gna11P21278 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms