Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bmp4P21275 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bmp4P21275 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms