Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PrkcaP20444 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms