Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TP20293 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TP20293 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TP20293 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TP20293 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TP20293 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TP20293 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TP20293 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TP20293 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TP20293 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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