Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NefhP19246 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NefhP19246 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NefhP19246 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NefhP19246 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NefhP19246 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NefhP19246 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NefhP19246 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NefhP19246 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NefhP19246 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NefhP19246 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms