Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tnnc1P19123 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms