Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P18533 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P18533 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18533 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P18533 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms