Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18525 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18525 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18525 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18525 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18525 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18525 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18525 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18525 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18525 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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P18525 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18525 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18525 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms