Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpraP18052 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtpraP18052 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpraP18052 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtpraP18052 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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