Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sptan1P16546 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms