Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd44P15379 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms