Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtcP11725 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
OtcP11725 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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