Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lamp1P11438 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp1P11438 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms