Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spp1P10923 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spp1P10923 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms