Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nid1P10493 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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