Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxb4P10284 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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