Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Spta1P08032 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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