Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PrlP06879 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PrlP06879 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrlP06879 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrlP06879 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PrlP06879 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PrlP06879 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PrlP06879 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PrlP06879 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms