Protein–RNA interactions for Protein: P06332

Cd4, T-cell surface glycoprotein CD4, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd4P06332 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd4P06332 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms