Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdgfrbP05622 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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