Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tk1P04184 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms