Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P01747 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P01747 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P01747 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P01747 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms